穴盘育苗的秧苗，其根坨呈上大下小的四棱锥体，故又称为“塞子苗”，采用穴盘育苗培育的秧苗具有苗龄短、幼苗整齐、健壮、无病虫害、定植后还苗快等优点。移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高。
每穴一粒，避免漏播，发芽率偏低的种子每穴播2粒。
覆盖基质：播种后用蛭石覆盖穴盘，方法是将蛭石倒在穴盘上，用刮板从穴盘的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，覆盖蛭石不要过厚，与格室相平为宜。
穴盘育苗在由填料、播种、催芽等过程中均可利用机械完成， 操作简单、快捷，育苗盘，适于规模化生产。
育苗穴盘的穴孔形状主要有方形和圆形，方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右，辣椒育苗盘，水分分布亦较均匀，种苗根系发育充分。草莓育苗盘属于加深型，塑料育苗盘，更适合根系发达的植物。
穴盘育苗由于统一播种和管理，使小苗生长发育一致，提高种苗品质，草莓育苗盘， 有利于规模化生产。
经过清洗并消毒的穴盘，亦可以重复使用
穴盘育苗培育的秧苗具有苗龄短、幼苗整齐、健壮
各穴孔填充程度要均匀一致，否则基较少的穴孔干燥的速度比较快，从而使水分管理不均衡
避免挤压基质，否则会影响基质的透气性和干燥速度，而且由于基质压得过紧，种子会反弹，导致种子终发芽时深浅不一。
底部无孔的可以用作化蛹盘，可孵化蚕蛹、蛋白虫、面包虫、黄粉虫等。
在子叶展开之前的水分管理比较简便，即要穴孔基质的下半部一直保持湿润。仅仅控制穴孔上半部分基质的干湿交替即可。
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