播种：将种子点在压好穴的盘中，每穴一粒，育苗盘，避免漏播，发芽率偏低的种子每穴播2粒。
覆盖基质：播种后用蛭石覆盖穴盘，方法是将蛭石倒在穴盘上，用刮板从穴盘的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，覆盖蛭石不要过厚，多肉育苗盘，与格室相平为宜。
用穴盘育苗种苗起苗移栽简捷、方便，不损伤根系，蔬菜育苗盘，定植成活率高，缓苗 期短。
穴盘苗便于存放，运输。
播瓜类等大粒种子的穴孔基质不可太满；
避免挤压基质，否则会影响基质的透气性和干燥速度，而且由于基质压得过紧，种子会反弹，导致种子终发芽时深浅不一。
育苗是蔬菜生产的关键技术环节，蔬菜集约化育苗技术主要是采用轻型基质作为育苗载体，穴盘作为主要容器进行生产的模式。根据生产需要，不同蔬菜品种、育苗季节、栽培模式等选用不同孔穴大小的穴盘。为了提高单位面积的产出率，在不影响育苗的前提下，应尽量选择孔穴较多的穴盘。
育苗穴盘的孔穴形状主要有圆形和方形，圆形孔侧平滑，四周没有直角，利于植物根系下扎和盘根，育苗盘，更适合小苗龄作物的生长；方形孔穴四角也从初的直角改变成圆角，所含基质一般要比圆形孔穴多 30% 左右，水分分布比较均匀，种苗根系发育充分，大苗龄蔬菜育苗多选用方形孔穴。
在运输车里穴盘可以立体多层摆放，非常适宜远距离运输。从播种室运到成苗室，或把穴盘苗从高温处移到低温处、从相对弱光处移到强光处，或从育苗室运到耕地里定植都很方便。节省育苗场地和降低成本。用穴盘播种，让小苗在穴盘里生长，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗、或定植.这样开始占地少，尤其适于在早春温度低时培育小苗，外界温度升高后再移入其他保护地培育成苗，可减少加温费用。如果不用较大的苗定植，可直接用穴盘苗栽培。
底部无孔的可以用作化蛹盘，可孵化蚕蛹、蛋白虫、面包虫、黄粉虫等。
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